MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	GAT	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380075
2	NC_006397	GTC	2	6	6352	6357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380075
3	NC_006397	GA	3	6	6430	6435	50 %	0 %	50 %	0 %	55380075
4	NC_006397	CTC	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380076
5	NC_006397	AAT	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380076
6	NC_006397	GA	3	6	7025	7030	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
7	NC_006397	GC	3	6	7045	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	55380076
8	NC_006397	GCGG	2	8	7114	7121	0 %	0 %	75 %	25 %	55380076
9	NC_006397	GCA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
10	NC_006397	GCGA	2	8	7276	7283	25 %	0 %	50 %	25 %	55380076
11	NC_006397	CAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380076
12	NC_006397	CA	3	6	7353	7358	50 %	0 %	0 %	50 %	55380076
13	NC_006397	GTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380076
14	NC_006397	TTC	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380076
15	NC_006397	AG	3	6	7473	7478	50 %	0 %	50 %	0 %	55380076
16	NC_006397	GTT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380076
17	NC_006397	ATC	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380076
18	NC_006397	TCG	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380076
19	NC_006397	GAT	2	6	7636	7641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380076
20	NC_006397	CAG	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
21	NC_006397	AGC	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
22	NC_006397	CAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380076
23	NC_006397	ATC	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380076
24	NC_006397	GTC	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380076
25	NC_006397	GTA	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380077
26	NC_006397	CGA	2	6	10380	10385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380078
27	NC_006397	CAA	2	6	10407	10412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380078
28	NC_006397	TC	3	6	10644	10649	0 %	50 %	0 %	50 %	55380078
29	NC_006397	CCG	2	6	10727	10732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380078
30	NC_006397	GGT	2	6	10741	10746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380078
31	NC_006397	CCA	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380078
32	NC_006397	TCT	2	6	10793	10798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380078
33	NC_006397	ATC	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380078
34	NC_006397	TCG	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380078
35	NC_006397	CGT	2	6	10942	10947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380078
36	NC_006397	GGCCCT	2	12	10956	10967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55380078
37	NC_006397	GAATC	2	10	11064	11073	40 %	20 %	20 %	20 %	55380078
38	NC_006397	AGG	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380078
39	NC_006397	GA	3	6	11175	11180	50 %	0 %	50 %	0 %	55380078
40	NC_006397	TCG	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380078
41	NC_006397	AT	3	6	11445	11450	50 %	50 %	0 %	0 %	55380079
42	NC_006397	ACA	3	9	11463	11471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380079
43	NC_006397	ATA	2	6	11475	11480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380079
44	NC_006397	CAG	2	6	11546	11551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380079
45	NC_006397	TAG	2	6	11565	11570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380079
46	NC_006397	TTC	2	6	12359	12364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380080
47	NC_006397	GTT	2	6	12391	12396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380080
48	NC_006397	TC	3	6	12403	12408	0 %	50 %	0 %	50 %	55380080
49	NC_006397	CGG	2	6	12444	12449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380080
50	NC_006397	ACC	2	6	12475	12480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380080
51	NC_006397	TGC	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380080
52	NC_006397	TCC	2	6	12498	12503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380080
53	NC_006397	CTG	2	6	12537	12542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380080
54	NC_006397	TCGA	2	8	12585	12592	25 %	25 %	25 %	25 %	55380080
55	NC_006397	CCG	2	6	12593	12598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380080
56	NC_006397	CGT	2	6	12640	12645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380080
57	NC_006397	CGA	2	6	12646	12651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380080
58	NC_006397	ACC	2	6	12660	12665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380080
59	NC_006397	TCG	2	6	12666	12671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380080
60	NC_006397	GCC	2	6	12677	12682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380080
61	NC_006397	TAC	3	9	12788	12796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380080
62	NC_006397	A	6	6	12828	12833	100 %	0 %	0 %	0 %	55380080
63	NC_006397	AGA	2	6	12874	12879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380080
64	NC_006397	ACC	2	6	12972	12977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380080
65	NC_006397	GAC	2	6	13028	13033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380080
66	NC_006397	CGC	2	6	13127	13132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380080
67	NC_006397	GAAC	2	8	13142	13149	50 %	0 %	25 %	25 %	55380080
68	NC_006397	ACGC	2	8	13184	13191	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
69	NC_006397	CACG	2	8	13205	13212	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
70	NC_006397	GTC	2	6	13247	13252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380080
71	NC_006397	ATC	2	6	13295	13300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380080
72	NC_006397	AGT	2	6	13335	13340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380081
73	NC_006397	TTG	2	6	13420	13425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380081
74	NC_006397	GCT	2	6	13488	13493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380081
75	NC_006397	ATC	2	6	13562	13567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380081
76	NC_006397	CCG	2	6	13593	13598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380081
77	NC_006397	TCC	2	6	13622	13627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380081
78	NC_006397	C	7	7	13630	13636	0 %	0 %	0 %	100 %	55380081
79	NC_006397	AG	4	8	13639	13646	50 %	0 %	50 %	0 %	55380081
80	NC_006397	TCG	3	9	13664	13672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380081
81	NC_006397	GTTG	2	8	13712	13719	0 %	50 %	50 %	0 %	55380081
82	NC_006397	CAT	2	6	13731	13736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380081
83	NC_006397	GTT	2	6	13750	13755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380081
84	NC_006397	GTC	2	6	13834	13839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380081
85	NC_006397	ATC	2	6	13885	13890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380081
86	NC_006397	TTG	2	6	13895	13900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380081
87	NC_006397	TGG	2	6	13960	13965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380081
88	NC_006397	TC	3	6	14079	14084	0 %	50 %	0 %	50 %	55380081
89	NC_006397	CTG	2	6	14139	14144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380081
90	NC_006397	GCG	2	6	14164	14169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380081
91	NC_006397	CAG	2	6	14206	14211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380081
92	NC_006397	AGC	2	6	14239	14244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380081
93	NC_006397	TTC	2	6	14550	14555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380082
94	NC_006397	GCT	2	6	14577	14582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380082
95	NC_006397	ACGA	2	8	14598	14605	50 %	0 %	25 %	25 %	55380082
96	NC_006397	GGA	2	6	15029	15034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380083
97	NC_006397	TCA	2	6	15065	15070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380083
98	NC_006397	GCTG	2	8	15287	15294	0 %	25 %	50 %	25 %	55380084
99	NC_006397	ACG	2	6	15296	15301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380084
100	NC_006397	CAC	2	6	15360	15365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380084
101	NC_006397	GAC	2	6	15509	15514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380084
102	NC_006397	CGT	2	6	15565	15570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380084
103	NC_006397	GGA	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380084
104	NC_006397	CAG	2	6	15629	15634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380084
105	NC_006397	CGA	2	6	15730	15735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380084
106	NC_006397	TCG	2	6	15747	15752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380084
107	NC_006397	GACA	2	8	15823	15830	50 %	0 %	25 %	25 %	55380084
108	NC_006397	CGG	2	6	15922	15927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380084
109	NC_006397	TAC	2	6	15940	15945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380084
110	NC_006397	CGT	2	6	16072	16077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380084
111	NC_006397	GCC	2	6	16087	16092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380084
112	NC_006397	CTC	2	6	16184	16189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380084
113	NC_006397	AC	3	6	16190	16195	50 %	0 %	0 %	50 %	55380084
114	NC_006397	CG	3	6	16281	16286	0 %	0 %	50 %	50 %	55380084
115	NC_006397	CGGGC	2	10	16333	16342	0 %	0 %	60 %	40 %	55380084
116	NC_006397	AG	3	6	16372	16377	50 %	0 %	50 %	0 %	55380084
117	NC_006397	CAG	2	6	16408	16413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380084
118	NC_006397	TGA	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380084
119	NC_006397	TCG	2	6	16553	16558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380085
120	NC_006397	GACG	2	8	16596	16603	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
121	NC_006397	GAC	2	6	16636	16641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380085
122	NC_006397	CGGA	2	8	16708	16715	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
123	NC_006397	CGA	2	6	16773	16778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380085
124	NC_006397	CCA	2	6	16803	16808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380085
125	NC_006397	GACC	2	8	16833	16840	25 %	0 %	25 %	50 %	55380085
126	NC_006397	TCGAGA	2	12	16874	16885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55380085
127	NC_006397	GCT	2	6	17099	17104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380086
128	NC_006397	GTT	2	6	17105	17110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380086
129	NC_006397	TCG	2	6	17137	17142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380086
130	NC_006397	TAC	2	6	17149	17154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380086
131	NC_006397	GCA	2	6	17180	17185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380086
132	NC_006397	ATT	2	6	17188	17193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380086
133	NC_006397	CTG	2	6	17726	17731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380087
134	NC_006397	CGT	2	6	17755	17760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380087
135	NC_006397	ACG	3	9	17946	17954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380087
136	NC_006397	TGT	2	6	17991	17996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380087
137	NC_006397	CGC	2	6	18013	18018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380087
138	NC_006397	GACACC	2	12	18053	18064	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55380087
139	NC_006397	CTC	2	6	18071	18076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380087
140	NC_006397	TGA	2	6	18336	18341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380088
141	NC_006397	CTG	2	6	18419	18424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380088
142	NC_006397	ATC	2	6	18426	18431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380088
143	NC_006397	GGCC	2	8	18461	18468	0 %	0 %	50 %	50 %	55380088
144	NC_006397	CGGC	2	8	18758	18765	0 %	0 %	50 %	50 %	55380089
145	NC_006397	TCAA	2	8	18792	18799	50 %	25 %	0 %	25 %	55380089
146	NC_006397	ACAG	2	8	18807	18814	50 %	0 %	25 %	25 %	55380089
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149	NC_006397	TCTG	2	8	18954	18961	0 %	50 %	25 %	25 %	55380089
150	NC_006397	GAC	2	6	18963	18968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380089
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152	NC_006397	CGA	2	6	19575	19580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380090
153	NC_006397	AG	3	6	19587	19592	50 %	0 %	50 %	0 %	55380090
154	NC_006397	CGGT	2	8	19607	19614	0 %	25 %	50 %	25 %	55380090
155	NC_006397	TAC	2	6	19711	19716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380090
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157	NC_006397	TGA	2	6	19769	19774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380090
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159	NC_006397	GCTAC	2	10	20826	20835	20 %	20 %	20 %	40 %	55380091
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162	NC_006397	CAG	2	6	21046	21051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380092
163	NC_006397	CG	3	6	21069	21074	0 %	0 %	50 %	50 %	55380092
164	NC_006397	AGC	2	6	21092	21097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380092
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170	NC_006397	TTG	2	6	21465	21470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380092
171	NC_006397	TGA	2	6	21494	21499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380092
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258	NC_006397	GAC	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
259	NC_006397	ACG	2	6	28082	28087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
260	NC_006397	CGA	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
261	NC_006397	GAG	2	6	28165	28170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380100
262	NC_006397	TAT	2	6	28842	28847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
263	NC_006397	GGT	2	6	28882	28887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380101
264	NC_006397	TGCCT	2	10	28934	28943	0 %	40 %	20 %	40 %	55380101
265	NC_006397	CTG	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
266	NC_006397	GCT	2	6	29150	29155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
267	NC_006397	TTA	2	6	29168	29173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
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270	NC_006397	TA	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	55380101
271	NC_006397	TCA	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380101
272	NC_006397	CTGT	2	8	29307	29314	0 %	50 %	25 %	25 %	55380101
273	NC_006397	AGCT	2	8	29389	29396	25 %	25 %	25 %	25 %	55380101
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278	NC_006397	TAT	2	6	29613	29618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
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280	NC_006397	TGT	2	6	29817	29822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380101
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282	NC_006397	CGCT	2	8	29946	29953	0 %	25 %	25 %	50 %	55380101
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290	NC_006397	GGT	2	6	30358	30363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380102
291	NC_006397	CGAC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	55380102
292	NC_006397	GCG	2	6	30393	30398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380102
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301	NC_006397	CG	3	6	30808	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	55380103
302	NC_006397	CAG	2	6	30859	30864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380103
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373	NC_006397	TCG	2	6	34819	34824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380108
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376	NC_006397	CGAAGT	2	12	34940	34951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55380108
377	NC_006397	TCCG	2	8	34962	34969	0 %	25 %	25 %	50 %	55380108
378	NC_006397	TGT	2	6	35009	35014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380108
379	NC_006397	CCA	2	6	35080	35085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380108
380	NC_006397	TGC	2	6	35190	35195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380108
381	NC_006397	CGTCT	2	10	35253	35262	0 %	40 %	20 %	40 %	55380108
382	NC_006397	GCG	2	6	35278	35283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380108
383	NC_006397	TGG	2	6	35397	35402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380108
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385	NC_006397	TGAA	2	8	36133	36140	50 %	25 %	25 %	0 %	55380109
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